Publicaciones

 

A continuación figura la lista de trabajos de investigación publicados que han sido posibles gracias al registro de investigación Simons Searchlight. Gracias a todas las familias por participar en Simons Searchlight. Nuestro objetivo a largo plazo es seguir ayudando a los investigadores y genetistas más destacados de todo el mundo a conocer sus trastornos genéticos o los de su familia.

Hemos resumido los puntos generales y las principales conclusiones de los artículos de investigación, aunque puede hacer clic en el enlace «Artículo completo» si desea ver el documento original.

Observará que hay muchos documentos que incluyen el nombre Simons Variation in Individuals Project o SimonsVIP. Esto se debe a que Simons Searchlight se llamaba originalmente SimonsVIP y son el mismo programa de investigación.

Hemos ordenado los artículos por fecha, del más antiguo al más reciente. Haga clic en las categorías siguientes para buscar publicaciones sobre enfermedades genéticas específicas. Hasta enero de 2023, los recursos de Simons Searchlight se han utilizado en 92 publicaciones y preprints, seguiremos resumiendo las publicaciones a medida que vayan saliendo.

La Fundación Simons anima a los investigadores a poner sus publicaciones a disposición del público de forma gratuita, lo que también se conoce como acceso abierto. Si no puede acceder a los artículos oficiales de la revista, le recomendamos que se ponga en contacto con el autor que figura en último lugar en el artículo para solicitar una copia.

Cómo leer los títulos de referencia de las publicaciones:

Después del título del artículo, incluimos otros detalles sobre dónde se publicó el artículo y el año en que se escribió. Si había más de 3 autores, se utilizan las palabras «et al» en lugar de enumerar a todos los autores. «Et al» significa «y otros». El nombre de la revista se taquigrafía.

Descargo de responsabilidad: Tenga en cuenta que los artículos publicados en medRxiv o bioRxiv no se revisan ni editan antes de su publicación en línea. Todos los demás artículos de las revistas aquí enumeradas han sido revisados por otros investigadores para controlar su calidad. Cuando un artículo se publica en medRxiv o bioRxiv, los investigadores pueden poner sus hallazgos inmediatamente a disposición de la comunidad médica y científica. Sin embargo, como no han sido revisados por otros investigadores, los resultados finales podrían ser algo diferentes una vez publicados oficialmente en una revista.

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Genetic Condition
Year of Publication
87 Publications
Alteraciones cerebrales subcorticales en portadores de variantes del número de copias genómicas
  • Los investigadores saben que las variantes del número de copias (VNC) pueden contribuir a trastornos del neurodesarrollo y psiquiátricos, como el autismo y la esquizofrenia. Una VNC se produce cuando hay un cambio en una sección del ADN que da lugar a la eliminación o duplicación de uno o varios genes. La deleción 16p11.2 es un ejemplo de una CNV.Show More
  • El objetivo de este estudio era comparar los tamaños y patrones de las regiones del cerebro para 11 CNV.
  • Los investigadores estudiaron las siguientes deleciones y duplicaciones: 1q21.1, 13q12.12, 15q11.2, 16p11.2, 16p13.11 y 22q11.2. También estudiaron las duplicaciones dentro del cromosoma 1, incluida la región TAR. En este estudio participaron 675 personas. Las imágenes de resonancia magnética cerebral de las CNV de 1q21.1 y 16p11.2 proceden de los participantes en Simons Searchlight.
  • Los investigadores descubrieron que las CNV con más genes eliminados o duplicados, como la 16p11.2, presentaban más cambios estructurales en la resonancia magnética. Las 11 CNV presentaban cambios en el grosor de la región cerebral que afecta a las funciones cognitivas, afectivas y sociales. Los mayores efectos se observaron en los participantes con una CNV 16p11.2 o 1q21.1.
  • Las duplicaciones 16p11.2 presentaban cambios en la estructura cerebral diferentes de los observados en personas con TEA y en personas sin diagnóstico genético. Esto sugiere que puede haber varios cambios cerebrales diferentes que pueden conducir al autismo.
  • Esta investigación contó con el apoyo de una subvención de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
medRxiv Preimpresión, (2023)
Kumar et al.

Tags:

1q21.1 deletion
1q21.1 duplication
Deleción 16p11.2
Duplicación 16p11.2
2023
Manifestaciones dentales notificadas por el cuidador en personas con trastornos genéticos del neurodesarrollo
  • Los niños con trastornos del neurodesarrollo (TND) tienen más probabilidades de tener problemas de salud dental que los niños sin un TND. A menudo, estos problemas de higiene dental se deben a la falta de cooperación durante el cepillado o las visitas al dentista.Show More
  • Para saber si las personas con TND tienen problemas dentales únicos, los investigadores encuestaron a los cuidadores de Simons Searchlight para preguntarles por las características dentales que presentaban las personas a su cargo. Esta pregunta la planteó un padre de una comunidad de Simons Searchlight.
  • Los investigadores estudiaron 39 afecciones genéticas, entre las que se encontraban 620 personas con un TND genético, y compararon los resultados con los de 145 hermanos sin ningún hallazgo genético.
  • En general, las personas del grupo NDD tenían más problemas de babeo, aparición tardía de los primeros dientes y forma anormal de los primeros y segundos dientes.
  • Es la primera vez que los investigadores descubren que las variaciones genéticas en CSNK2A1, DYRK1A y PPP2R5D se asocian a características dentales específicas.
  • Aproximadamente la mitad de los niños con una END relacionada con CSNK2A1 presentaban defectos en sus primeros dientes, como dientes frontales más largos que la media, dientes agrietados, falta de esmalte, dientes pequeños o dientes fusionados.
  • Aproximadamente la mitad de los niños con una variante genética DYRK1A perjudicial presentaban retraso en la aparición de los primeros dientes.
  • Por último, aproximadamente 2 de cada 3 niños con una variante genética patógena PPP2R5D presentaban babeo excesivo.Show Less
Int J Paediatr Dent Publicación electrónica antes de impresión, (2023)
Ming et al.

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CSNK2A1
DYRK1A
PPP2R5D
Todos los genes
2023
Las CNV raras y los perfiles de todo el fenotipo ponen de relieve la divergencia estructural del cerebro y la convergencia fenotípica
  • Estos investigadores compararon las estructuras cerebrales de personas con variantes en el número de copias (VNC) y personas del Biobanco del Reino Unido pertenecientes a la población general. Este estudio incluyó ocho CNV: deleciones o duplicaciones de 1q21.1, 15p11.2, 16p11.2 y 22q11.2.Show More
  • Este estudio incluyó participantes de varios estudios de investigación o universidades: Simons Searchlight; Universidad de Cardiff; Consorcio Europeo 16p11.2; Universidad de Montreal; y Universidad de California, Los Ángeles. Había 548 personas con una NVC y 312 personas sin afección genética.
  • Los investigadores utilizaron análisis informáticos para estudiar las características cerebrales de cada una de las CNV y crearon uno de los mayores estudios de imágenes cerebrales realizados hasta la fecha.
  • Hicieron una comparación entre las estructuras cerebrales y las características médicas para encontrar vínculos entre ambas. Su objetivo era comprender cómo la estructura cerebral puede dar lugar a comportamientos.
  • Los volúmenes cerebrales eran menores en los participantes con deleción 1q21.1, duplicación 15p11.2, duplicación 16p11.2 y deleción 22q11.2. Los volúmenes cerebrales eran mayores en las personas con duplicación 1q21.1, deleción 15p11.2, deleción 16p11.2 y duplicación 22q11.2.
  • Descubrieron que las personas con una deleción 16p11.2 o una deleción 22q11.2 tenían patrones cerebrales únicos, mientras que las personas con una duplicación 15p11.2 tenían estructuras cerebrales similares a las de la población general.
  • Las personas con una deleción 16p11.2 tenían el mayor número de regiones cerebrales afectadas, mientras que las personas con una duplicación 15p11.2 tenían el menor número de regiones afectadas.
  • Los investigadores crearon un gráfico que mostraba la red a gran escala de cada VNC y estudiaron las características de las personas con una VNC, como el tamaño corporal, el estilo de vida y los factores sanguíneos. Las ocho VNC presentaban fuertes asociaciones con la presión arterial diastólica, una proteína llamada fosfatasa alcalina y el recuento de glóbulos rojos.
  • Esta investigación contó con el apoyo de una subvención de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Nat Hum Behav Publicación electrónica antes de impresión, (2023)
Kopal et al.

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1q21 deletion
1q21 duplication
Deleción 16p11.2
Duplicación 16p11.2
2023
El análisis multinivel del eje intestino-cerebro muestra perfiles moleculares y microbianos asociados al trastorno del espectro autista
  • Muchas personas con autismo también tienen problemas gastrointestinales, como estreñimiento, diarrea o hinchazón abdominal. Para entender por qué puede ser así, los investigadores se han centrado en la conexión intestino-cerebro estudiando los vínculos entre las hormonas, el sistema inmunitario y el sistema nervioso.Show More
  • El microbioma intestinal es el conjunto de bacterias, arqueas, hongos y virus que viven en el intestino de una persona y contribuyen a la digestión.
  • Se ha sugerido que una alteración en la conexión intestino-cerebro (también llamada eje intestino-cerebro) desempeña un papel en los trastornos del neurodesarrollo. Los estudios sobre el microbioma en el autismo no han arrojado resultados consistentes.
  • En este estudio, los investigadores compararon 25 estudios y conjuntos de datos diferentes para identificar patrones en personas con autismo. Estos estudios contaban con 1.193 muestras, incluidas muestras de sangre, orina y heces. Los investigadores utilizaron datos de deleción 16p11.2 de Simons Searchlight.
  • Los investigadores tuvieron dificultades para identificar un patrón entre los estudios porque los hallazgos eran más consistentes dentro de los estudios que entre ellos. Sugirieron que esto podría deberse a la edad, el sexo o la ubicación global de los participantes en cada estudio.
  • En los análisis por edades y sexos, los investigadores hallaron diferencias entre el microbioma de los niños con autismo y el de los niños sin autismo. Los investigadores denominaron a esto una señal del microbioma del autismo.
  • Puede existir un vínculo entre el microbioma y la dieta. Los investigadores descubrieron que los autistas consumen menos alimentos enriquecidos con determinados aminoácidos que son importantes para ayudar al organismo a fabricar neurotransmisores. Los neurotransmisores son mensajeros biológicos que transportan señales químicas de una célula cerebral a otra.
  • Los investigadores descubrieron que un microbioma central formado por Bacteroides, Prevotella, Bifidobacteria, Desulfovibrio y múltiples productores de butirato está relacionado con el autismo. Este hallazgo sugiere que el microbioma intestinal puede desempeñar un papel en la configuración de los síntomas del autismo.
  • Los investigadores no encontraron ninguna relación entre una variación genética específica y el microbioma de una persona.
  • Los investigadores concluyeron que nuestra comprensión de la relación entre el intestino y el cerebro en el autismo es aún muy limitada, y que se necesitan más estudios para poder sacar conclusiones más amplias.Show Less
Nat Neurosci. 26, 1208-1217 (2023)
Morton et al.

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Deleción 16p11.2
Todos los genes
2023
Desarrollo de medidas de rendimiento social y cognitivo recogidas por webcam y derivadas de inteligencia artificial para síndromes genéticos del neurodesarrollo.
  • Estudiar la capacidad social y cognitiva de personas con síndromes genéticos del neurodesarrollo es difícil no sólo porque se trata de enfermedades poco frecuentes, sino también porque exige detectar diferencias sutiles. Poder observar incluso pequeños cambios en la capacidad social y cognitiva de una persona es importante para evaluar la eficacia de un fármaco o medicamento personalizado.Show More
  • En este estudio, los investigadores crearon un método de seguimiento ocular basado en una cámara web que utiliza la cámara del ordenador doméstico o portátil de los participantes para detectar hacia dónde miran cuando se les muestran vídeos e imágenes. Esta fue la primera vez que los investigadores intentaron desarrollar un método amplio multi-condición para su uso a distancia sin un clínico, y para su uso en personas con discapacidad intelectual.
  • Los investigadores reclutaron a los participantes a través de organizaciones de defensa del paciente y Simons Searchlight, y utilizaron la información de los participantes en la base de datos de Simons Searchlight. Los participantes tenían entre 3 y 45 años. Las comunidades genéticas que participaron a través de Simons Searchlight incluyeron GRIN2B, CSNK2A1, HIVEP2, SCN2A, MED13L y STXBP1.
  • En el estudio participaron 375 personas, 163 de ellas con un síndrome genético del neurodesarrollo, 56 con un trastorno del neurodesarrollo sin diagnóstico genético y 156 sin problemas de neurodesarrollo. Los investigadores utilizaron inteligencia artificial para analizar las grabaciones de los participantes y recopilaron encuestas de los cuidadores.
  • Se encuestó a los participantes con esta nueva medida en 3 momentos diferentes. En la encuesta se analizaron diversos aspectos de la atención social, el grado de comprensión del vocabulario, la rapidez con que se procesaba la información y la lectura de una sola palabra.
  • Los investigadores constataron que en todas las áreas evaluadas existían sólidos indicios de validez, lo que sugiere que este método podría ser coherente y fiable para esta comunidad. Una excepción fue el ámbito social, que mide la expresión emocional positiva y negativa.
  • Los participantes con discapacidad intelectual tenían niveles más bajos en todas las medidas siguientes: atención, revisión intencionada de la pantalla, atención y preferencia social, lectura de una sola palabra, velocidad de reconocimiento de imágenes en pantalla y comprensión de vocabulario.
  • En general, los participantes con un síndrome genético del neurodesarrollo mostraron un estado neuroconductual más deteriorado, incluida una menor atención, una mayor preferencia por lo no social, una peor capacidad para comprender el vocabulario y la lectura de una sola palabra, y una velocidad más lenta ante las caras y los objetos.
  • Se descubrió que algunas afecciones genéticas presentaban patrones de grupo. Por ejemplo, los participantes con SYNGAP1 tenían puntuaciones más altas en expresividad emocional negativa.
  • Los investigadores sugirieron que este nuevo método podría utilizarse de forma coherente en personas con discapacidad cognitiva de leve a moderada, pero que la coherencia podría ser menor en personas con discapacidad cognitiva grave.
  • Esta investigación contó con el apoyo de una subvención de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Am J Med Genet C Semin Med Genet. 193, e32058 (2023)
Frazier et al.

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CSNK2A1
GRIN2B
HIVEP2
MED13L
SCN2A
STXBP1
2023
Fenotipos del neurodesarrollo asociados a variantes patogénicas en SLC6A1
  • Esta es la primera publicación sobre SLC6A1 que incluye datos de Simons Searchlight.Show More
  • SLC6A1 son las siglas de solute carrier 6 family member 1, y es importante para que las células cerebrales reciban señales de otras células cerebrales. Los cambios en el gen SLC6A1 suelen provocar convulsiones. Las crisis más frecuentes son las crisis de ausencia.
  • Los investigadores estudiaron a 28 participantes de Simons Searchlight con una variante genética patogénica o probablemente patogénica en SLC6A1. Esto se suma a las 116 personas con variantes genéticas SLC6A1 que se han publicado hasta la fecha en la literatura médica.
  • En este estudio, la mayoría de las variantes genéticas eran de novo, es decir, un cambio aleatorio que se produce en el niño. Sin embargo, algunas de las variantes genéticas se heredaron de uno de los progenitores.
  • La mayoría de los participantes tenían convulsiones, bajo tono muscular, problemas de lenguaje o retraso del habla, discapacidad intelectual o retraso del desarrollo y problemas con la motricidad gruesa.
  • Entre las características médicas menos comunes de los participantes se encontraban el autismo, los trastornos del movimiento, los problemas de sueño y una elevada tolerancia al dolor.
  • Esta investigación contó con el apoyo de una subvención de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
J Med Genet 59, 536-543 (2022)
Kahen et al.

Tags:

SLC6A1
2022
El aprendizaje automático contrastivo revela la estructura de la variación neuroanatómica dentro del autismo
  • Estos investigadores utilizaron imágenes cerebrales y programas informáticos para identificar los patrones de estructura cerebral de las personas que padecen autismo. Utilizaron el conjunto de datos de imágenes por resonancia magnética (IRM) Autism Brain Imaging Data Exchange I (ABIDE I) de 470 personas con autismo para crear las principales teorías de imagen. Compararon las imágenes de personas con autismo con 512 imágenes de personas sin autismo.Show More
  • A continuación, los investigadores utilizaron 121 imágenes de los datos de Simons Searchlight 16p11.2 para validar lo que habían encontrado y ver si podían identificar a las personas con diagnóstico de autismo.
  • Los investigadores observaron variaciones en las estructuras cerebrales de las personas y que algunas partes del cerebro son más difíciles de visualizar que otras. Descubrieron que las estructuras cerebrales específicas del autismo son diferentes a distintas edades, por lo que las comparaciones deben hacerse dentro de grupos de edad, no entre edades. También señalaron que, debido a la gran variación de los cerebros, es difícil saber qué diferencias se deben a la variación cerebral normal y cuáles al autismo. Por lo tanto, hay que estudiar los mismos cerebros a lo largo del tiempo para saber cómo se desarrollan.
  • Su modelo informático fue capaz de identificar patrones individuales de estructura cerebral específicos del autismo y relacionarlos con las características clínicas de un participante, como las conductas repetitivas y el comportamiento adaptativo. Los investigadores utilizaron los datos de Simons Searchlight para reconfirmar las conclusiones de sus datos de ABIDE I.
  • Esta investigación contó con el apoyo de una subvención de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Ciencia 376, 1070-1074 (2022)
Aglinskas et al.

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Deleción 16p11.2
Duplicación 16p11.2
2022