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Fecha de revisión: Enero 2024

Gracias a todas las familias por participar en Simons Searchlight. Con tu participación, pretendemos ayudar a los investigadores y genetistas de todo el mundo a comprender los trastornos genéticos que te afectan a ti o a tu familia.

La investigación realizada con los datos de Simons Searchlight ha dado lugar a numerosos artículos publicados. Estos trabajos se someten a un proceso de revisión por pares, en el que otros científicos evalúan y validan la investigación antes de su publicación en revistas científicas. Además, algunos hallazgos se comparten mediante preprints, lo que permite una rápida difusión de la información a la comunidad científica.

Muchas de las publicaciones llevan el nombre «Simons Variation in Individuals Project» (SimonsVIP), que era el nombre original de nuestro programa de investigación, ahora conocido como Simons Searchlight.

Los artículos listados están organizados cronológicamente, del más antiguo al más reciente. Puedes explorar las publicaciones por condiciones genéticas específicas utilizando las categorías que aparecen a continuación.

Hasta abril de 2024, Simons Searchlight ha contribuido a 98 publicaciones y preprints, y seguiremos resumiendo las nuevas publicaciones.

En cuanto a la accesibilidad, la Fundación Simons anima a los investigadores a que sus publicaciones sean de acceso abierto. Si no puedes acceder a un artículo de una revista, te recomendamos que te pongas en contacto con el último autor que aparezca en el artículo para solicitar una copia.

Comprender los títulos de referencia de las publicaciones:

-El título del artículo va seguido de los detalles de publicación, incluyendo dónde y cuándo se publicó.
– Si hay más de tres autores, utilizamos «et al.» para representar a los colaboradores adicionales.
– Las revistas se referencian utilizando nombres abreviados.

Descargo de responsabilidad: Ten en cuenta que los artículos publicados en medRxiv (pronunciado med-archive) o bioRxiv (pronunciado bio-archive) no son revisados por pares ni editados antes de su publicación en línea. En cambio, todos los demás artículos que figuran aquí han sido revisados por colegas investigadores para garantizar su calidad y exactitud. Aunque publicar en medRxiv o bioRxiv permite a los investigadores compartir sus hallazgos rápidamente, los resultados finales publicados pueden diferir tras someterse a una revisión formal por pares para su publicación en una revista.

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87 Publications

Alteraciones cerebrales subcorticales en portadores de variantes del número de copias genómicas

Los investigadores saben que las variantes del número de copias (VNC) pueden contribuir a trastornos del neurodesarrollo y psiquiátricos, como el autismo y la esquizofrenia. Una VNC se produce cuando hay un cambio en una sección del ADN que hace que un gen o varios genes se supriman o dupliquen. La deleción 16p11.2 es un ejemplo de una CNV. Show More
El objetivo de este estudio era comparar los tamaños y patrones de las regiones del cerebro para 11 CNV.
Los investigadores estudiaron las siguientes deleciones y duplicaciones: 1q21.1, 13q12.12, 15q11.2, 16p11.2, 16p13.11 y 22q11.2. También estudiaron las duplicaciones dentro del cromosoma 1, incluida la región TAR. En este estudio participaron 675 personas. Las imágenes de resonancia magnética cerebral para las CNV de 1q21.1 y 16p11.2 procedían de participantes en el Simons Searchlight.
Los investigadores descubrieron que las CNV con más genes suprimidos o duplicados, como la 16p11.2, presentaban más cambios estructurales en la resonancia magnética. Las 11 CNV presentaban cambios en el grosor de la región cerebral que afecta a las funciones cognitivas, afectivas y sociales. Los mayores efectos se observaron en los participantes con una VNC 16p11.2 o 1q21.1.
Las duplicaciones 16p11.2 presentaban cambios en la estructura cerebral diferentes de los observados en personas con TEA y en personas sin diagnóstico genético. Esto sugiere que puede haber varios cambios cerebrales diferentes que pueden conducir al autismo.
Esta investigación contó con el apoyo de una subvención de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less

medRxiv Preimpresión, (2023)

Kumar et al.

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1q21.1 deletion

1q21.1 duplication

Deleción 16p11.2

Duplicación 16p11.2

2023

Manifestaciones dentales notificadas por el cuidador en personas con trastornos genéticos del neurodesarrollo

Los niños con trastornos del neurodesarrollo (TND) tienen más probabilidades de tener problemas de salud dental que los niños sin un TND. A menudo, estos problemas de higiene dental se deben a la falta de cooperación durante el cepillado o las visitas al dentista. Show More
Para saber si las personas con TND tienen problemas dentales únicos, los investigadores encuestaron a los cuidadores de Simons Searchlight para preguntarles por las características dentales que presentaban sus dependientes. Esta pregunta fue planteada por un padre de una comunidad de Simons Searchlight.
Los investigadores estudiaron 39 afecciones genéticas, entre las que se encontraban 620 personas con un TND genético, y compararon los resultados con los de 145 hermanos sin ningún hallazgo genético.
En general, las personas del grupo NDD tenían más problemas de babeo, aparición tardía de los primeros dientes y forma anormal de los primeros y segundos dientes.
Es la primera vez que los investigadores descubren que las variaciones genéticas en CSNK2A1, DYRK1A y PPP2R5D se asocian a características dentales específicas.
Aproximadamente la mitad de los niños con una END relacionada con CSNK2A1 presentaban defectos en sus primeros dientes, como dientes frontales más largos que la media, dientes agrietados, falta de esmalte, dientes pequeños o dientes fusionados.
Aproximadamente la mitad de los niños con una variante genética DYRK1A perjudicial presentaban retraso en la aparición de los primeros dientes.
Por último, aproximadamente 2 de cada 3 niños con una variante genética patógena PPP2R5D presentaban babeo excesivo.Show Less

Int J Paediatr Dent Publicación electrónica antes de impresión, (2023)

Ming et al.

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CSNK2A1

DYRK1A

PPP2R5D

Todos los genes

2023

Las CNV raras y los perfiles de todo el fenotipo ponen de relieve la divergencia estructural del cerebro y la convergencia fenotípica

Estos investigadores compararon las estructuras cerebrales de personas con variantes del número de copias (VNC) y personas del Biobanco del Reino Unido que pertenecían a la población general. Este estudio incluyó ocho VNC: deleciones o duplicaciones de 1q21.1, 15p11.2, 16p11.2 y 22q11.2. Show More
Este estudio incluyó participantes de varios estudios de investigación o universidades: Simons Searchlight; Universidad de Cardiff; Consorcio Europeo 16p11.2; Universidad de Montreal; y Universidad de California, Los Ángeles. Había 548 personas con una NVC y 312 personas sin afección genética.
Los investigadores utilizaron análisis informáticos para estudiar las características cerebrales de cada una de las CNV y crearon uno de los mayores estudios de imágenes cerebrales realizados hasta la fecha.
Hicieron una comparación entre las estructuras cerebrales y las características médicas para encontrar vínculos entre ambas. Pretendían comprender cómo la estructura cerebral puede conducir a comportamientos.
Los volúmenes cerebrales eran menores en los participantes con una deleción 1q21.1, una duplicación 15p11.2, una duplicación 16p11.2 y una deleción 22q11.2. Los volúmenes cerebrales eran mayores en las personas con una duplicación 1q21.1, una deleción 15p11.2, una deleción 16p11.2 y una duplicación 22q11.2.
Descubrieron que las personas con una deleción 16p11.2 o una deleción 22q11.2 tenían patrones cerebrales únicos, mientras que las personas con una duplicación 15p11.2 tenían estructuras cerebrales similares a las de la población general.
Las personas con una deleción 16p11.2 tenían el mayor número de regiones cerebrales afectadas, mientras que las personas con una duplicación 15p11.2 tenían el menor número de regiones afectadas.
Los investigadores crearon un gráfico que mostraba la red a gran escala de cada VNC, y estudiaron las características de las personas con una VNC, como el tamaño corporal, el estilo de vida y los factores sanguíneos. Los ocho VNC tenían fuertes asociaciones con la presión arterial diastólica, una proteína llamada fosfatasa alcalina y el recuento de glóbulos rojos.
Esta investigación contó con el apoyo de una subvención de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less

Nat Hum Behav Publicación electrónica antes de impresión, (2023)

Kopal et al.

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1q21 deletion

1q21 duplication

Deleción 16p11.2

Duplicación 16p11.2

2023

El análisis multinivel del eje intestino-cerebro muestra perfiles moleculares y microbianos asociados al trastorno del espectro autista

Muchas personas con autismo también tienen problemas gastrointestinales, como estreñimiento, diarrea o hinchazón abdominal. Para entender a qué puede deberse esto, los investigadores se han centrado en la conexión intestino-cerebro estudiando los vínculos entre las hormonas, el sistema inmunitario y el sistema nervioso. Show More
El microbioma intestinal es el conjunto de bacterias, arqueas, hongos y virus que viven en el intestino de una persona y contribuyen a la digestión.
Se ha sugerido que una alteración en la conexión intestino-cerebro (también llamada eje intestino-cerebro) desempeña un papel en los trastornos del neurodesarrollo. Los estudios sobre el microbioma en el autismo no han tenido resultados consistentes.
En este estudio, los investigadores compararon 25 estudios y conjuntos de datos diferentes para identificar patrones en personas con autismo. Estos estudios tenían 1.193 muestras, incluidas muestras de sangre, orina y heces. Los investigadores utilizaron los datos de deleción 16p11.2 de Simons Searchlight.
Los investigadores tuvieron dificultades para identificar un patrón entre los estudios porque los resultados eran más consistentes dentro de los estudios que entre ellos. Sugirieron que esto podría deberse a la edad, el sexo o la ubicación global de los participantes en cada estudio.
En análisis emparejados por edad y sexo, los investigadores hallaron una diferencia entre el microbioma de los niños con autismo y el de los niños sin autismo. Los investigadores denominaron a esto una señal del microbioma del autismo.
Puede existir una relación entre el microbioma y la dieta. Los investigadores descubrieron que los autistas consumen menos alimentos enriquecidos con determinados aminoácidos que son importantes para ayudar al organismo a fabricar neurotransmisores. Los neurotransmisores son mensajeros biológicos que transportan señales químicas de una célula cerebral a otra.
Los investigadores descubrieron que un microbioma central formado por Bacteroides, Prevotella, Bifidobacteria, Desulfovibrio y múltiples productores de butirato está relacionado con el autismo. Este hallazgo sugiere que el microbioma intestinal puede desempeñar un papel en la configuración de los síntomas del autismo.
Los investigadores no encontraron ninguna relación entre una variación genética específica y el microbioma de una persona.
Los investigadores concluyeron que nuestra comprensión de la relación entre el intestino y el cerebro en el autismo es aún muy limitada, y que se necesitan más estudios para poder sacar conclusiones más amplias.Show Less

Nat Neurosci. 26, 1208-1217 (2023)

Morton et al.

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Deleción 16p11.2

Todos los genes

2023

Desarrollo de medidas de rendimiento social y cognitivo recogidas por webcam y derivadas de inteligencia artificial para síndromes genéticos del neurodesarrollo.

Estudiar la capacidad social y cognitiva en personas con síndromes genéticos del neurodesarrollo es difícil no sólo porque las afecciones son raras, sino también porque requiere la detección de diferencias sutiles. Poder observar incluso pequeños cambios en la capacidad social y cognitiva de una persona es importante para evaluar la eficacia de un fármaco o medicamento personalizado. Show More
En este estudio, los investigadores crearon un método de seguimiento ocular basado en una cámara web que utiliza la cámara del ordenador doméstico o portátil de los participantes para detectar dónde miran los participantes cuando se les muestran vídeos e imágenes. Ésta fue la primera vez que los investigadores intentaron desarrollar un método amplio de múltiples condiciones para utilizarlo a distancia sin un clínico, y para utilizarlo en personas con discapacidad intelectual.
Los investigadores reclutaron a los participantes a través de organizaciones de defensa del paciente y de Simons Searchlight, y utilizaron la información de los participantes de la base de datos de Simons Searchlight. Los participantes tenían entre 3 y 45 años. Las comunidades genéticas que participaron a través de Simons Searchlight fueron GRIN2B, CSNK2A1, HIVEP2, SCN2A, MED13L y STXBP1.
El estudio incluyó a 375 participantes, 163 de ellos con un síndrome genético del neurodesarrollo, 56 con una afección del neurodesarrollo pero sin diagnóstico genético, y 156 sin ningún problema de neurodesarrollo. Los investigadores utilizaron inteligencia artificial para analizar las grabaciones de los participantes, y recogieron encuestas informadas por los cuidadores.
Se encuestó a los participantes con esta nueva medida en 3 momentos diferentes. La encuesta analizaba varias partes de la atención social, cuánto vocabulario se comprendía, con qué rapidez se procesaba la información y la lectura de una sola palabra.
Los investigadores descubrieron que en todas las áreas evaluadas había pruebas sólidas de validez, lo que sugiere que este método podría ser coherente y fiable para esta comunidad. Una excepción fue en el ámbito social, que mide la expresión emocional positiva y negativa.
Los participantes con discapacidad intelectual tenían niveles más bajos en todas las medidas siguientes: atención, revisión intencionada de la pantalla, atención y preferencia social, lectura de una sola palabra, velocidad de reconocimiento de imágenes en pantalla y comprensión de vocabulario.
En general, los participantes con un síndrome genético del neurodesarrollo mostraron un estado neuroconductual más deteriorado, incluida una menor atención, una mayor preferencia por lo no social, una peor capacidad para comprender el vocabulario y la lectura de una sola palabra, y una velocidad más lenta ante las caras y los objetos.
Se descubrió que algunas condiciones genéticas presentaban patrones de grupo. Por ejemplo, los participantes con SYNGAP1 tenían puntuaciones más altas en expresividad emocional negativa.
Los investigadores sugirieron que este nuevo método podría utilizarse de forma coherente en personas con discapacidad cognitiva de leve a moderada, pero que la coherencia podría ser menor en personas con discapacidad cognitiva grave.
Esta investigación contó con el apoyo de una subvención de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less

Am J Med Genet C Semin Med Genet. 193, e32058 (2023)

Frazier et al.

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SLC6A1

2022

El aprendizaje automático contrastivo revela la estructura de la variación neuroanatómica dentro del autismo

Estos investigadores utilizaron imágenes cerebrales y programas informáticos para identificar los patrones de estructura cerebral de las personas con autismo. Utilizaron el conjunto de datos de imágenes por resonancia magnética (IRM) del Intercambio de Datos de Imágenes Cerebrales del Autismo I (ABIDE I) de 470 personas con autismo para crear las teorías principales de las imágenes. Compararon las imágenes de personas con autismo con 512 imágenes de personas sin autismo. Show More
Después, los investigadores utilizaron 121 imágenes de los datos de Simons Searchlight 16p11.2 para validar lo que habían descubierto y ver si podían identificar a las personas con diagnóstico de autismo.
Los investigadores observaron variaciones en las estructuras cerebrales de las personas y que algunas partes del cerebro son más difíciles de visualizar que otras. Descubrieron que las estructuras cerebrales específicas del autismo son diferentes a distintas edades, por lo que las comparaciones deben hacerse dentro de grupos de edad, no entre edades. También observaron que, debido a la gran variación de los cerebros, es difícil saber qué diferencias se deben a la variación normal del cerebro y qué diferencias se deben al autismo. Por tanto, deben estudiarse los mismos cerebros a lo largo del tiempo para saber cómo se desarrollan.
Su modelo informático fue capaz de identificar patrones individuales de estructura cerebral específicos del autismo y relacionarlos con los rasgos clínicos de un participante, como las conductas repetitivas y el comportamiento adaptativo. Los investigadores utilizaron los datos de Simons Searchlight para reconfirmar las conclusiones de sus datos de ABIDE I.
Esta investigación contó con el apoyo de una subvención de la Iniciativa de Investigación sobre el Autismo de la Fundación Simons(SFARI).Show Less

Ciencia 376, 1070-1074 (2022)

Aglinskas et al.

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