Veröffentlichungen

Datum der Überarbeitung: Januar 2024

Vielen Dank an alle Familien, die an Simons Searchlight teilgenommen haben. Durch Ihr Engagement wollen wir Forschern und Genetikern weltweit helfen, genetische Störungen zu verstehen, die Sie oder Ihre Familie betreffen.

Die mit den Daten von Simons Searchlight durchgeführten Untersuchungen haben zu zahlreichen Veröffentlichungen geführt. Diese Arbeiten werden einem Peer-Review-Verfahren unterzogen, bei dem andere Wissenschaftler die Forschungsergebnisse bewerten und bestätigen, bevor sie in wissenschaftlichen Zeitschriften veröffentlicht werden. Darüber hinaus werden einige Ergebnisse über Preprints veröffentlicht, die eine schnelle Verbreitung der Informationen in der wissenschaftlichen Gemeinschaft ermöglichen.

Viele der Veröffentlichungen tragen den Namen “Simons Variation in Individuals Project” (SimonsVIP), was der ursprüngliche Name unseres Forschungsprogramms war, das jetzt als Simons Searchlight bekannt ist.

Die aufgelisteten Artikel sind chronologisch geordnet, vom ältesten bis zum neuesten. Sie können die Publikationen nach bestimmten genetischen Bedingungen durchsuchen, indem Sie die nachstehenden Kategorien verwenden.

Bis April 2024 hat Simons Searchlight zu 98 Publikationen und Preprints beigetragen, und wir werden weiterhin neue Publikationen zusammenfassen.

Um die Zugänglichkeit zu gewährleisten, ermutigt die Simons Foundation Forscher, ihre Publikationen offen zugänglich zu machen. Wenn Sie keinen Zugang zu einem Zeitschriftenartikel haben, empfehlen wir Ihnen, sich an den letzten Autor zu wenden, der in dem Artikel aufgeführt ist, um eine Kopie zu erhalten.

Verstehen der Titel von Veröffentlichungen:

-Der Titel des Artikels wird gefolgt von den Angaben zur Veröffentlichung, einschließlich Ort und Datum der Veröffentlichung.
– Wenn es mehr als drei Autoren gibt, verwenden wir “et al.”, um weitere Mitwirkende darzustellen.
– Zeitschriften werden mit Kurzbezeichnungen referenziert.

Haftungsausschluss: Bitte beachten Sie, dass die auf medRxiv (sprich: med-archive) oder bioRxiv (sprich: bio-archive) veröffentlichten Artikel vor der Online-Veröffentlichung nicht von Fachkollegen geprüft oder bearbeitet werden. Im Gegensatz dazu wurden alle anderen hier aufgeführten Artikel von Forscherkollegen geprüft, um Qualität und Genauigkeit sicherzustellen. Während die Veröffentlichung auf medRxiv oder bioRxiv es den Forschern ermöglicht, ihre Ergebnisse schnell mitzuteilen, können die endgültigen veröffentlichten Ergebnisse nach der formalen Peer Review für die Veröffentlichung in einer Zeitschrift abweichen.

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91 Publications

Von Betreuern gemeldete zahnmedizinische Symptome bei Personen mit genetischen neurologischen Entwicklungsstörungen

Kinder mit neurologischen Entwicklungsstörungen (NDD) haben häufiger Probleme mit der Zahngesundheit als Kinder ohne eine NDD. Häufig sind diese Zahnhygieneprobleme auf mangelnde Kooperation beim Zähneputzen oder beim Zahnarztbesuch zurückzuführen.Show More
Um herauszufinden, ob Menschen mit NDD besondere Zahnprobleme haben, befragten die Forscher die Betreuer von Simons Searchlight nach Zahnmerkmalen bei ihren Angehörigen. Diese Frage wurde von einem Elternteil in einer Simons Searchlight Gemeinde gestellt.
Die Forscher untersuchten 39 genetische Bedingungen, darunter 620 Personen mit einer genetischen NDD, und verglichen die Ergebnisse mit denen von 145 Geschwistern ohne genetischen Befund.
Im Allgemeinen gab es in der NDD-Gruppe mehr Probleme mit dem Sabbern, dem späten Auftreten der ersten Zähne und der abnormen Form der ersten und zweiten Zähne.
Dies ist das erste Mal, dass Forscher genetische Variationen in CSNK2A1, DYRK1A und PPP2R5D mit spezifischen Zahnmerkmalen in Verbindung brachten.
Etwa die Hälfte der Kinder mit einer CSNK2A1-bedingten NDD hatte Defekte an den ersten Zähnen, wie z. B. überlange Frontzähne, rissige Zähne, fehlenden Zahnschmelz, kleine Zähne oder verschmolzene Zähne.
Etwa die Hälfte der Kinder mit einer schädigenden DYRK1A-Genvariante hatte ein verzögertes Erscheinen der ersten Zähne.
Schließlich hatten etwa 2 von 3 Kindern mit einer pathogenen PPP2R5D-Genvariante übermäßiges Sabbern.Show Less

Int J Paediatr Dent Epub ahead of print, (2023)

Ming et al.

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Alle Gene

CSNK2A1

DYRK1A

PPP2R5D

2023

Rezeptive Sprache und rezeptiv-expressive Diskrepanz bei minimal verbalen autistischen Kindern und Jugendlichen

Für etwa 30 Prozent der Autisten ist die sprachliche Kommunikation sehr schwierig, und viele von ihnen werden bis ins Erwachsenenalter nicht in der Lage sein zu sprechen, auch bekannt als minimal verbal. Die Forscher wollten herausfinden, wie viel Menschen mit geringem Sprachvermögen verstehen können, wenn sie angesprochen werden. Diese Art des Verstehens wird als rezeptive Sprache bezeichnet.Show More
Anhand von Elternbefragungen und Beurteilungen maßen die Forscher die nonverbalen kognitiven Fähigkeiten der Teilnehmer, um ihr rezeptives Sprachniveau zu ermitteln.
In diese Studie wurden Kinder und Jugendliche im Alter von 5 bis 18 Jahren mit einer Autismus-Diagnose aufgenommen. Die Daten der Teilnehmer stammen aus Simons Searchlight, Simons Simplex Collection und Autism Inpatient Collection sowie aus der National Database for Autism Research. Die Studie umfasste 1.579 Teilnehmer mit minimalem Sprachgebrauch.
Die Forscher fanden heraus, dass Kinder und Jugendliche, die sich nur wenig verbal ausdrücken konnten, im Durchschnitt eine geringere rezeptive Sprache aufwiesen als gleichaltrige Gleichaltrige. Je älter die Kinder wurden, desto größer waren die Unterschiede in der rezeptiven Sprache.
In der Gruppe waren jedoch die Werte für die rezeptive Sprache höher als die für die expressive Sprache, was darauf hindeutet, dass die Teilnehmer mehr verstehen konnten, als sie selbst auszudrücken vermochten.
Die Forscher fanden heraus, dass soziale Kompetenzen, die anhand einer von den Eltern durchgeführten Umfrage gemessen wurden, in dieser Studie in hohem Maße mit der rezeptiven Sprachfähigkeit einer Person assoziiert sind.
Schließlich fanden die Forscher heraus, dass bessere motorische Fähigkeiten, gemessen durch eine Umfrage zu Entwicklungskoordinationsstörungen, der beste Prädiktor für eine Diskrepanz zwischen gesprochener und verstandener Sprache waren. Dies deutet darauf hin, dass je besser die motorischen Fähigkeiten eines minimal verbalen Kindes oder Jugendlichen sind, desto wahrscheinlicher ist es, dass sie die Sprache, die ihnen vermittelt wird, besser verstehen.
Die Forscher schlugen vor, dass der Vineland Adaptive Behavior Score, der in vielen Studien und im Rahmen von Simons Searchlight als Standard für adaptive Verhaltensweisen verwendet wird, im Vergleich zu einigen der anderen verwendeten Maßstäbe das am besten geeignete Maß für minimal verbale Menschen ist.
Die Forscher vermuten, dass Kinder mit besseren motorischen Fähigkeiten besser mit verschiedenen Aktivitäten und Umgebungen in Kontakt kommen können, was die Sprachentwicklung fördert.Show Less

Autismus Res Epub ahead of print, (2023)

Chen et al.

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Alle Gene

2023

Seltene CNVs und phänomenweite Profilerstellung unterstreichen strukturelle Divergenz und phänotypische Konvergenz im Gehirn

Die Forscher verglichen die Gehirnstrukturen von Menschen mit Kopienzahlvarianten (CNVs) mit denen von Menschen aus der britischen Biobank, die der Allgemeinbevölkerung angehören. Diese Studie umfasste acht CNVs: Deletionen oder Duplikationen von 1q21.1, 15p11.2, 16p11.2 und 22q11.2.Show More
An dieser Studie nahmen Teilnehmer aus mehreren Forschungsstudien oder Universitäten teil: Simons Searchlight; Cardiff University; 16p11.2 European Consortium; University of Montreal; und University of California, Los Angeles. Darunter waren 548 Personen mit einer CNV und 312 Personen ohne genetische Erkrankung.
Die Forscher untersuchten mit Hilfe der Computeranalytik die Gehirnmerkmale der einzelnen CNVs und erstellten eine der bisher größten Studien zur Bildgebung des Gehirns.
Sie haben einen Vergleich zwischen Gehirnstrukturen und medizinischen Merkmalen angestellt, um Verbindungen zwischen beiden zu finden. Sie wollten verstehen, wie die Gehirnstruktur zu Verhaltensweisen führen kann.
Das Hirnvolumen war bei Teilnehmern mit einer 1q21.1-Deletion, 15p11.2-Duplikation, 16p11.2-Duplikation und 22q11.2-Deletion kleiner. Das Gehirnvolumen war bei Menschen mit einer 1q21.1-Duplikation, 15p11.2-Deletion, 16p11.2-Deletion und 22q11.2-Duplikation größer.
Sie fanden heraus, dass Menschen mit einer 16p11.2-Deletion oder 22q11.2-Deletion einzigartige Gehirnmuster aufweisen, während Menschen mit einer 15p11.2-Duplikation Gehirnstrukturen haben, die denen der Allgemeinbevölkerung ähneln.
Bei Menschen mit einer 16p11.2-Deletion waren die meisten Hirnregionen betroffen, während bei Menschen mit einer 15p11.2-Duplikation die wenigsten Regionen betroffen waren.
Die Forscher erstellten ein Diagramm, das das großräumige Netzwerk jeder CNV zeigt, und sie untersuchten Merkmale von Menschen mit einer CNV, wie Körpergröße, Lebensstil und Blutfaktoren. Alle acht CNVs waren stark mit dem diastolischen Blutdruck, einem Protein namens alkalische Phosphatase und der Anzahl der roten Blutkörperchen verbunden.
Diese Forschung wurde durch einen Zuschuss der Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI) unterstützt.Show Less

Nat Hum Behav Epub ahead of print, (2023)

Kopal et al.

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16p11.2 Deletie

16p11.2-Duplikat

1q21-Deletion

1q21-Duplikation

2023

Mehrstufige Analyse der Darm-Hirn-Achse zeigt mit Autismus-Spektrum-Störungen assoziierte molekulare und mikrobielle Profile

Viele Menschen mit Autismus haben auch Magen-Darm-Probleme, wie Verstopfung, Durchfall oder Blähungen im Bauch. Um zu verstehen, woran das liegen könnte, haben sich die Forscher auf die Verbindung zwischen Darm und Gehirn konzentriert, indem sie die Zusammenhänge zwischen Hormonen, dem Immunsystem und dem Nervensystem untersucht haben.Show More
Das Darmmikrobiom ist die Gesamtheit der Bakterien, Archaeen, Pilze und Viren, die im Darm eines Menschen leben und bei der Verdauung helfen.
Es wird vermutet, dass eine Störung der Verbindung zwischen Darm und Gehirn (auch Darm-Hirn-Achse genannt) eine Rolle bei neurologischen Entwicklungsstörungen spielt. Studien über das Mikrobiom bei Autismus haben keine einheitlichen Ergebnisse erbracht.
In dieser Studie verglichen die Forscher 25 verschiedene Studien und Datensätze, um Muster bei Menschen mit Autismus zu erkennen. Diese Studien umfassten 1.193 Proben, darunter Blut-, Urin- und Stuhlproben. Die Forscher verwendeten 16p11.2-Deletionsdaten von Simons Searchlight.
Die Forscher hatten Schwierigkeiten, ein Muster zwischen den Studien zu erkennen, da die Ergebnisse innerhalb der Studien konsistenter waren als zwischen den Studien. Sie vermuten, dass dies auf das Alter, das Geschlecht oder den globalen Standort der Teilnehmer in den einzelnen Studien zurückzuführen sein könnte.
In alters- und geschlechtsspezifischen Analysen fanden die Forscher einen Unterschied zwischen dem Mikrobiom von Kindern mit Autismus und Kindern ohne Autismus. Die Forscher nannten dies ein Autismus-Mikrobiom-Signal.
Möglicherweise gibt es einen Zusammenhang zwischen dem Mikrobiom und der Ernährung. Die Forscher fanden heraus, dass Autisten weniger Lebensmittel zu sich nehmen, die mit bestimmten Aminosäuren angereichert sind, die für die Bildung von Neurotransmittern im Körper wichtig sind. Neurotransmitter sind biologische Botenstoffe, die chemische Signale von einer Gehirnzelle zur nächsten übertragen.
Die Forscher fanden heraus, dass ein Kernmikrobiom, das aus Bacteroides, Prevotella, Bifidobakterien, Desulfovibrio und mehreren Butyratproduzenten besteht, mit Autismus in Verbindung steht. Dieser Befund deutet darauf hin, dass das Darmmikrobiom eine Rolle bei der Ausprägung von Autismus-Symptomen spielen könnte.
Die Forscher fanden keinen Zusammenhang zwischen einer bestimmten genetischen Variation und dem Mikrobiom einer Person.
Die Forscher kamen zu dem Schluss, dass unser Wissen über die Verbindung zwischen Darm und Gehirn bei Autismus noch sehr begrenzt ist und dass weitere Studien erforderlich sind, um größere Schlussfolgerungen ziehen zu können.Show Less

Nat Neurosci. 26, 1208-1217 (2023)

Morton et al.

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16p11.2 Deletie

Alle Gene

2023

Der Immunstatus von Patienten mit 16p11.2-Deletionssyndrom

In der üblichen 16p11.2-Deletionsregion, die auch als proximale Deletion bezeichnet wird, befinden sich mehrere Gene, die für die Immunfunktion wichtig sind. Die Immunitätsgene innerhalb der Region 16p11.2 sind CORO1A, MAPK3 und SPN. Es gibt noch einige andere immunassoziierte Gene, die sich außerhalb dieser Region befinden.Show More
Die Forscher wollten wissen, ob es einen Zusammenhang zwischen einer 16p11.2-Deletion und Immunproblemen gibt.
In dieser Studie verwendeten die Forscher die Angaben von 170 Simons Searchlight-Teilnehmern mit einer 16p11.2-Deletion.
Die meisten Teilnehmer, nämlich 138 von 170 (81 Prozent), gaben an, dass sie in der Vergangenheit an schweren Infektionen gelitten haben. Die häufigste Infektionskategorie waren Ohrinfektionen, die mehr als 8 Mal auftraten, gefolgt von Infektionen der Atemwege und Lungenentzündungen. Elf Teilnehmer (6,5 Prozent) gaben an, dass bei ihnen eine Immunschwäche diagnostiziert wurde. Diese Ergebnisse waren ähnlich wie bei den Teilnehmern mit einer 16p11.2-Deletion, die von Forschern des Children's Hospital Colorado rekrutiert wurden.
Die Forscher verglichen ihre Ergebnisse mit einer Gruppe von Teilnehmern, die keine 16p11.2-Deletion haben, und in dieser Vergleichsgruppe gab es keine Hinweise auf eine Infektion oder Autoimmunprobleme.
Der Artikel enthält eine detaillierte Tabelle mit allen gemeldeten Infektionen bei Menschen mit und ohne 16p11.2-Deletion.
Die Forscher schlugen vor, dass Menschen mit einer 16p11.2-Deletion von einer zusätzlichen immunologischen Untersuchung durch ihren behandelnden Arzt profitieren könnten.Show Less

J Clin Immunol 43, 1792-1795 (2023)

Wang et al.

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16p11.2 Deletie

2023

Entwicklung von per Webcam erfassten und von künstlicher Intelligenz abgeleiteten Messungen der sozialen und kognitiven Leistung bei genetischen Syndromen der Neuroentwicklung

Die Untersuchung sozialer und kognitiver Fähigkeiten bei Menschen mit genetischen Syndromen der Neuroentwicklung ist nicht nur deshalb schwierig, weil diese Erkrankungen selten sind, sondern auch, weil sie die Feststellung subtiler Unterschiede erfordert. Selbst kleine Veränderungen der sozialen und kognitiven Fähigkeiten einer Person zu erkennen, ist wichtig, um die Wirksamkeit eines Medikaments oder einer personalisierten Medizin zu beurteilen.Show More
In dieser Studie entwickelten die Forscher eine Webcam-basierte Blickverfolgungsmethode, die die Kamera des Heimcomputers oder Laptops der Teilnehmer nutzt, um zu erkennen, wohin die Teilnehmer schauen, wenn sie Videos und Bilder sehen. Es war das erste Mal, dass Forscher versuchten, eine Methode mit mehreren Bedingungen zu entwickeln, die aus der Ferne ohne einen Kliniker und bei Menschen mit geistiger Behinderung angewendet werden kann.
Die Forscher rekrutierten die Teilnehmer über Patientenorganisationen und Simons Searchlight und nutzten die Teilnehmerinformationen aus der Simons Searchlight-Datenbank. Die Teilnehmer waren zwischen 3 und 45 Jahre alt. Zu den genetischen Gemeinschaften, die an Simons Searchlight teilnahmen, gehören GRIN2B, CSNK2A1, HIVEP2, SCN2A, MED13L und STXBP1.
An der Studie nahmen 375 Personen teil, darunter 163 mit einem genetischen Syndrom für neurologische Entwicklung, 56 mit einer neurologischen Entwicklungsstörung, aber ohne genetische Diagnose, und 156 ohne neurologische Probleme. Die Forscher setzten künstliche Intelligenz ein, um die Aufzeichnungen der Teilnehmer zu analysieren, und sie sammelten Umfragen unter den Betreuern.
Die Teilnehmer wurden mit dieser neuen Maßnahme zu 3 verschiedenen Zeitpunkten befragt. Untersucht wurden verschiedene Bereiche der sozialen Aufmerksamkeit, der Umfang des verstandenen Wortschatzes, die Geschwindigkeit der Informationsverarbeitung und das Lesen einzelner Wörter.
Die Forscher stellten fest, dass es in allen bewerteten Bereichen starke Hinweise auf die Validität gab, was darauf hindeutet, dass diese Methode für diese Gemeinschaft konsistent und zuverlässig sein könnte. Eine Ausnahme bildete der soziale Bereich, in dem positive und negative Gefühlsäußerungen gemessen werden.
Teilnehmer mit geistiger Behinderung wiesen bei allen folgenden Messungen niedrigere Werte auf: Aufmerksamkeit, absichtliches Betrachten des Bildschirms, soziale Aufmerksamkeit und Präferenz, Lesen von Einzelwörtern, Geschwindigkeit des Erkennens von Bildern auf dem Bildschirm und Wortschatzverständnis.
Im Allgemeinen zeigten Teilnehmer mit einem genetischen Syndrom für neurologische Entwicklung ein stärker beeinträchtigtes neurologisches Verhalten, einschließlich geringerer Aufmerksamkeit, höherer nicht-sozialer Präferenz, schlechterer Fähigkeit zum Verstehen von Vokabeln und zum Lesen von Einzelwörtern sowie langsamerer Geschwindigkeit bei Gesichtern und Objekten.
Es wurde festgestellt, dass einige genetische Bedingungen Gruppenmuster aufweisen. Zum Beispiel hatten die Teilnehmer mit SYNGAP1 höhere Werte für negative emotionale Ausdrucksfähigkeit.
Die Forscher schlugen vor, dass diese neue Methode bei Menschen mit leichten bis mittelschweren kognitiven Behinderungen durchgängig angewandt werden könnte, bei Menschen mit schweren kognitiven Behinderungen könnte die Durchgängigkeit jedoch geringer sein.
Diese Forschung wurde durch einen Zuschuss der Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI) unterstützt.Show Less

Am J Med Genet C Semin Med Genet. 193, e32058 (2023)

Frazier et al.

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CSNK2A1

GRIN2B

HIVEP2

MED13L

SCN2A

STXBP1

2023

Subkortikale Hirnveränderungen bei Trägern von genomischen Kopienzahlvarianten

Forscher wissen, dass Kopienzahlvarianten (CNV) zu neurologischen und psychiatrischen Störungen, wie Autismus und Schizophrenie, beitragen können. Eine CNV entsteht durch eine Veränderung in einem DNA-Abschnitt, die dazu führt, dass ein Gen oder mehrere Gene gelöscht oder verdoppelt werden. Die 16p11.2-Deletion ist ein Beispiel für eine CNV.Show More
Ziel dieser Studie war es, die Größen und Muster der Gehirnregionen für 11 CNVs zu vergleichen.
Die Forscher untersuchten die folgenden Deletionen und Duplikationen: 1q21.1, 13q12.12, 15q11.2, 16p11.2, 16p13.11 und 22q11.2. Sie untersuchten auch Duplikationen innerhalb von Chromosom 1, einschließlich der TAR-Region. Diese Studie umfasste 675 Teilnehmer. MRT-Bilder des Gehirns für 1q21.1 und 16p11.2 CNVs stammen von Simons Searchlight-Teilnehmern.
Die Forscher fanden heraus, dass CNVs mit mehr gelöschten oder verdoppelten Genen, wie z. B. 16p11.2, mehr strukturelle Veränderungen im MRT aufwiesen. Alle 11 CNVs wiesen Veränderungen in der Dicke der Gehirnregion auf, die kognitive, affektive und soziale Funktionen beeinflusst. Die größten Auswirkungen wurden bei Teilnehmern mit 16p11.2 oder 1q21.1 CNVs beobachtet.
16p11.2-Duplikationen wiesen Veränderungen der Gehirnstruktur auf, die sich von denen unterscheiden, die bei Menschen mit ASD und Menschen ohne genetische Diagnose zu beobachten sind. Dies deutet darauf hin, dass es mehrere verschiedene Gehirnveränderungen geben kann, die zu Autismus führen können.
Diese Forschung wurde durch einen Zuschuss der Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI) unterstützt.Show Less

medRxiv Vorabdruck, (2023)

Kumar et al.

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