Publicações

Data de revisão: Janeiro de 2024

Obrigado a todas as famílias por participarem do Simons Searchlight. Com o seu envolvimento, pretendemos ajudar pesquisadores e geneticistas de todo o mundo a entender os distúrbios genéticos que afetam você ou sua família.

A pesquisa realizada com os dados do Simons Searchlight resultou em vários artigos publicados. Esses artigos passam por um processo de revisão por pares, no qual outros cientistas avaliam e validam a pesquisa antes da publicação em revistas científicas. Além disso, algumas descobertas são compartilhadas por meio de pré-impressões, permitindo a rápida disseminação de informações para a comunidade científica.

Muitas das publicações apresentam o nome “Simons Variation in Individuals Project” (SimonsVIP), que era o nome original do nosso programa de pesquisa, agora conhecido como Simons Searchlight.

Os artigos listados estão organizados em ordem cronológica, do mais antigo ao mais recente. Você pode explorar publicações por condições genéticas específicas usando as categorias abaixo.

Em abril de 2024, o Simons Searchlight contribuiu para 98 publicações e pré-impressões, e continuaremos a resumir novas publicações.

Para acessibilidade, a Fundação Simons incentiva os pesquisadores a tornar suas publicações de acesso aberto. Se você não conseguir acessar um artigo de periódico, recomendamos que entre em contato com o último autor listado no artigo para solicitar uma cópia.

Entendendo os títulos de referência de publicações:

-O título do artigo é seguido pelos detalhes da publicação, incluindo onde e quando ele foi publicado.
– Se houver mais de três autores, usamos “et al.” para representar colaboradores adicionais.
– As revistas são referenciadas usando nomes abreviados.

Isenção de responsabilidade: esteja ciente de que os artigos publicados no medRxiv (pronuncia-se med-archive) ou no bioRxiv (pronuncia-se bio-archive) não são revisados por pares ou editados antes da publicação on-line. Em contrapartida, todos os outros artigos listados aqui foram revisados por colegas pesquisadores para garantir a qualidade e a precisão. Embora a publicação no medRxiv ou no bioRxiv permita que os pesquisadores compartilhem as descobertas rapidamente, os resultados finais publicados podem ser diferentes depois de passarem pela revisão formal por pares para publicação em periódicos.

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91 Publications
Características clínicas, de neuroimagem e moleculares dos distúrbios do desenvolvimento neurológico relacionados ao PPP2R5D: Uma série ampliada com caracterização funcional e análise genótipo-fenótipo
  • Esta é a primeira publicação sobre o PPP2R5D que se concentra nos dados do Simons Searchlight.Show More
  • PPP2R5D significa proteína fosfatase 2 subunidade reguladora B delta. Nas células, a PPP2R5D é uma enzima que adiciona uma molécula chamada fosfato aos aminoácidos serina e treonina.
  • Esse estudo inclui 72 participantes do Simons Searchlight com uma variante genética patogênica ou provavelmente patogênica no PPP2R5D. Isso se soma às 31 pessoas com variantes genéticas PPP2R5D que foram publicadas até o momento na literatura médica.
  • Os pesquisadores estudaram as variantes genéticas da função PPP2R5D e agruparam as variantes em três categorias diferentes.
  • A idade dos participantes variou de 1 a 45 anos. A maioria dos participantes tinha pouco tônus muscular e um tamanho de cabeça maior do que a média. Cerca de metade dos participantes teve convulsões, com uma idade média de início de convulsão de pouco mais de 2 anos. A atividade das convulsões variava entre os participantes: alguns tinham mais de 100 convulsões por dia, outros tinham uma por ano.
  • Os participantes tiveram mais dificuldade com a comunicação expressiva e com as habilidades pessoais de vida diária. Cerca de 1 em cada 3 participantes tinha refluxo ácido e constipação.
  • Os pesquisadores descobriram que cerca de 1 em cada 5 participantes tinha atraso no desenvolvimento ou deficiência intelectual, o que é menor do que o relatado por outros estudos.
  • Os pesquisadores verificaram se havia alguma ligação entre as variantes genéticas e as características médicas. A maioria das pessoas com Glu198Lys e Trp207Arg apresentou o conjunto mais consistente de características médicas; ambas as variantes estão na mesma categoria funcional.
  • Esse foi o maior estudo realizado até o momento com participantes com uma variante genética PPP2R5D. Pela primeira vez, os pesquisadores puderam investigar em grande escala a função que as variantes genéticas têm na célula em relação às características clínicas.
J Med Genet Epub ahead of print, (2022)
Oyama et al.
Full Article

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PPP2R5D
2022
Identificação de genes controladores específicos do tipo de célula em loci de número de cópias associados ao autismo a partir de organoides cerebrais
  • O objetivo dessa pesquisa foi estudar quais genes são ativados e desativados nos diferentes tipos de células do cérebro em pessoas com uma variante do número de cópias (CNV). Uma CNV ocorre quando há uma alteração em uma seção do DNA que resulta na exclusão ou duplicação de um gene ou de vários genes. A deleção 16p11.2 é um exemplo de CNV.Show More
  • Os pesquisadores usaram células-tronco pluripotentes induzidas (iPSCs) de a) nove participantes do Simons Searchlight com deleção 16p11.2, b) quatro participantes com uma duplicação 15q11-13, e c) doze participantes sem alterações genéticas de um biobanco diferente. As iPSCs foram usadas para criar minicérebros em laboratório. Os pesquisadores são capazes de criar minicérebros que se comunicam entre si, de forma semelhante ao que acontece com um cérebro humano, mas os minicérebros são menos complexos do que os cérebros humanos.
  • O estudo das CNVs é difícil porque as pessoas com uma CNV têm vários genes excluídos ou duplicados. Isso torna difícil saber quais genes podem estar afetando diferentes partes do desenvolvimento humano.
  • Os pesquisadores desenvolveram um novo processo para sequenciar e analisar células individuais dos minicérebros. Eles usaram uma técnica chamada CRISPR/Cas9 para editar os cérebros e confirmar suas descobertas genéticas.
  • Os pesquisadores encontraram três genes na região 16p11.2 que podem afetar o desenvolvimento das células cerebrais. Esses genes foram YPEL3, KCTD13 e INO80E.
  • Esta pesquisa foi apoiada por um subsídio da Iniciativa de Pesquisa sobre Autismo da Fundação Simons (SFARI).
Nat Commun 13, 3243 (2022)
Lim et al.
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Deleção 16p11.2
Duplicação de 16p11.2
2022
Fenótipos de neurodesenvolvimento associados a variantes patogênicas no SLC6A1
  • Esta é a primeira publicação sobre o SLC6A1 que inclui dados do Simons Searchlight.Show More
  • SLC6A1 significa solute carrier 6 family member 1 (membro da família 1 do transportador de soluto 6) e é importante para que as células cerebrais recebam sinais de outras células cerebrais. As alterações no gene SLC6A1 geralmente resultam em convulsões. As crises mais comuns são as crises de ausência.
  • Os pesquisadores estudaram 28 participantes do Simons Searchlight com uma variante genética patogênica ou provavelmente patogênica no SLC6A1. Isso se soma às 116 pessoas com variantes genéticas SLC6A1 publicadas até o momento na literatura médica.
  • Nesse estudo, a maioria das variantes genéticas era de novo, que é uma mudança aleatória que ocorre na criança. Porém, algumas das variantes genéticas foram herdadas de um dos pais.
  • A maioria dos participantes tinha convulsões, baixo tônus muscular, problemas de linguagem ou atraso na fala, deficiência intelectual ou atraso no desenvolvimento e problemas com habilidades motoras grossas.
  • As características médicas menos comuns dos participantes incluíam autismo, distúrbios de movimento, problemas de sono e alta tolerância à dor.
  • Esta pesquisa foi apoiada por um subsídio da Iniciativa de Pesquisa sobre Autismo da Fundação Simons (SFARI).
J Med Genet 59, 536-543 (2022)
Kahen et al.
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SLC6A1
2022
O aprendizado de máquina contrastivo revela a estrutura da variação neuroanatômica no autismo
  • Esses pesquisadores usaram imagens do cérebro e software de computador para identificar os padrões da estrutura cerebral em pessoas com autismo. Eles usaram o conjunto de dados de ressonância magnética (MRI) do Autism Brain Imaging Data Exchange I (ABIDE I) de 470 pessoas com autismo para criar as principais teorias de imagem. Eles compararam as imagens de pessoas com autismo com 512 imagens de pessoas sem autismo.Show More
  • Em seguida, os pesquisadores usaram 121 imagens dos dados do Simons Searchlight 16p11.2 para validar o que encontraram e verificar se podiam identificar pessoas com diagnóstico de autismo.
  • Os pesquisadores notaram variações nas estruturas cerebrais das pessoas e que algumas partes do cérebro são mais difíceis de serem visualizadas do que outras. Eles descobriram que as estruturas cerebrais específicas do autismo são diferentes em diferentes idades, portanto, as comparações devem ser feitas dentro das faixas etárias, e não entre as idades. Eles também observaram que, devido à grande variação nos cérebros, é difícil saber quais diferenças se devem à variação normal do cérebro e quais diferenças se devem ao autismo. Portanto, os mesmos cérebros devem ser estudados ao longo do tempo para saber como eles se desenvolvem.
  • Seu modelo de computador foi capaz de identificar padrões individuais de estrutura cerebral específicos do autismo e relacioná-los às características clínicas de um participante, como comportamentos repetitivos e comportamento adaptativo. Os pesquisadores usaram os dados do Simons Searchlight para confirmar novamente as descobertas de seus dados do ABIDE I.
  • Esta pesquisa foi apoiada por um subsídio da Iniciativa de Pesquisa sobre Autismo da Fundação Simons(SFARI).
Ciência 376, 1070-1074 (2022)
Aglinskas et al.
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Deleção 16p11.2
Duplicação de 16p11.2
2022
A desregulação da sinalização mTOR medeia defeitos comuns de neurite e migração em células precursoras neurais idiopáticas e de autismo com deleção 16p11.2
  • O objetivo dessa pesquisa foi descobrir se há semelhanças no desenvolvimento do cérebro entre pessoas com autismo de causa genética e pessoas com autismo sem causa genética identificada.Show More
  • Os participantes com autismo que não tem causa genética conhecida foram convidados para o estudo. O estudo também incluiu participantes do Simons Searchlight com uma deleção 16p11.2. Foram coletadas amostras biológicas de todos os participantes. Também foram coletadas amostras dos irmãos dos participantes que não tinham autismo. As células dos participantes foram transformadas em células cerebrais que puderam ser estudadas em laboratório.
  • Os pesquisadores descobriram que as células cerebrais de laboratório dos participantes com a deleção 16p11.2 cresciam e se moviam de forma diferente das células cerebrais de laboratório de seus irmãos, que não tinham a deleção. As células com deleção 16p11.2 eram mais semelhantes às células dos participantes com autismo que não tinham causa genética. Essas descobertas sugerem que o autismo pode se desenvolver seguindo um processo de desenvolvimento comum.
  • No entanto, os pesquisadores encontraram algumas diferenças entre as células com deleção 16p11.2 e as células dos participantes com autismo que não tinham causa genética. Eles acreditavam que as diferenças poderiam ser devidas à capacidade das células de responder aos fatores de comunicação.
  • Os pesquisadores descobriram que o controle rígido do processo de comunicação celular - nem muito, nem pouco - é muito importante para o desenvolvimento do cérebro.
bioRxiv Pré-impressão, (2022)
Prem et al.
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Deleção 16p11.2
2022
Breve relatório: Diferenças na atenção naturalista a cenas do mundo real em adolescentes com deleção 16p.11.2
  • O objetivo desta pesquisa foi estudar as manifestações clínicas específicas em pessoas com uma deleção 16p11.2.Show More
  • Pessoas com deleção 16p11.2 têm uma taxa maior de autismo e de traços relacionados ao autismo.
  • Os pesquisadores realizaram estudos de rastreamento ocular em 21 participantes adolescentes e adultos com uma deleção 16p11.2 e 23 participantes sem uma condição genética. Os participantes com uma deleção 16p11.2 foram recrutados no Simons Searchlight.
  • Os pesquisadores usaram um fone de ouvido de realidade virtual para mostrar aos participantes cenas do mundo real, com objetos, pessoas ou cenários de fundo. Os pesquisadores criaram mapas de rastreamento ocular com base naquilo em que o participante se concentrava.
  • Os pesquisadores descobriram que o sexo, o QI e os traços autistas não eram bons indicadores daquilo em que o participante se concentrava. Os participantes com deleção 16p11.2 observaram menos em cada cena e tiveram menos fixações. Os pesquisadores sugeriram estudar participantes mais jovens com uma deleção 16p11.2 para ver se surgiria um padrão mais óbvio.
J Autism Dev Disord Epub ahead of print, (2022)
Haskins et al.
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Deleção 16p11.2
2022
Características clínicas de convulsões e epilepsia em indivíduos com deleções e duplicações recorrentes na região 16p11.2
  • Os pesquisadores tinham como objetivo analisar quantas pessoas com uma variante do número de cópias 16p11.2 (CNV) desenvolvem convulsões ou epilepsia. Uma CNV ocorre quando há uma alteração em uma seção do DNA que resulta na exclusão ou duplicação de um gene ou de vários genes. A deleção 16p11.2 é um exemplo de CNV.Show More
  • Esse estudo incluiu participantes do Simons Searchlight: 129 com uma deleção 16p11.2 e 106 com uma duplicação 16p11.2.
  • Dos 129 participantes com deleção 16p11.2, descobriu-se que 31 tiveram pelo menos uma convulsão (24%). Quando avaliados quanto à epilepsia, 23 dos 129 participantes (18%) receberam um diagnóstico de epilepsia. Os participantes com deleção 16p11.2 tiveram sua primeira convulsão entre o nascimento e os 14 anos de idade. O tipo de convulsão mais comum foi a convulsão focal.
  • Dos 106 participantes com uma duplicação 16p11.2, 17 tiveram pelo menos uma convulsão (16%). Além disso, 12 participantes receberam um diagnóstico de epilepsia (11%). Os participantes tiveram sua primeira convulsão entre 1 e 10 anos de idade. O tipo de convulsão mais comum também foi uma convulsão focal nos participantes com duplicação 16p11.2.
  • O sucesso do tratamento anti-convulsivo variou entre os participantes.
  • Esse documento inclui tabelas de resumo com todos os tipos de crises e detalhes da epilepsia de todos os participantes.
  • Essa pesquisa confirmou que a ocorrência de convulsões está associada à CNV 16p11.2. A imagem cerebral por ressonância magnética, que foi realizada em apenas um pequeno número de participantes, não explicou a presença de atividade cerebral anormal.
Neurol Genet 8, e200018 (2022)
Moufawad et al.
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Deleção 16p11.2
Duplicação de 16p11.2
2022