Publications

 

Vous trouverez ci-dessous la liste des articles de recherche publiés grâce au registre de recherche Simons Searchlight. Merci à toutes les familles d’avoir participé à Simons Searchlight. Notre objectif à long terme est de continuer à aider les chercheurs et les généticiens de premier plan du monde entier à en savoir plus sur les maladies génétiques dont vous ou votre famille souffrez.

Nous avons résumé les points généraux et les principaux résultats des articles de recherche, mais vous pouvez cliquer sur le lien “Article complet” si vous souhaitez consulter l’article original.

Vous remarquerez que de nombreux documents portent le nom de Simons Variation in Individuals Project ou SimonsVIP. En effet, Simons Searchlight s’appelait à l’origine SimonsVIP et il s’agit d’un seul et même programme de recherche.

Nous avons classé les articles par ordre de date, du plus ancien au plus récent. Veuillez cliquer sur les catégories ci-dessous pour rechercher des publications sur des conditions génétiques spécifiques. En janvier 2023, les ressources de Simons Searchlight ont été utilisées dans 92 publications et prépublications. Nous continuerons à résumer les publications au fur et à mesure de leur parution.

La Fondation Simons encourage les chercheurs à mettre leurs publications à la disposition du public, ce que l’on appelle le “libre accès”. Si vous ne pouvez pas accéder aux articles officiels du journal, nous vous recommandons de contacter l’auteur mentionné en dernier dans l’article pour en demander une copie.

Comment lire les titres de référence des publications :

Après le titre de l’article, nous incluons d’autres détails concernant l’endroit où l’article a été publié et l’année où il a été écrit. S’il y a plus de trois auteurs, les mots “et al” sont utilisés au lieu d’énumérer tous les auteurs. “Et al” signifie “et autres”. Le nom de la revue est écrit en abrégé.

Avertissement : Veuillez noter que les articles publiés dans medRxiv (prononcé med-archive) ou bioRxiv (prononcé bio-archive) ne font pas l’objet d’un examen par les pairs ou d’une révision avant d’être mis en ligne. Tous les autres articles publiés dans les revues répertoriées ici ont été revus par d’autres chercheurs à des fins de contrôle de la qualité. Lorsqu’un article est publié sur medRxiv ou bioRxiv, les chercheurs peuvent immédiatement mettre leurs résultats à la disposition de la communauté médicale et scientifique. Toutefois, comme ils n’ont pas été examinés par d’autres chercheurs, les résultats finaux peuvent être légèrement différents une fois qu’ils sont officiellement publiés dans une revue.

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91 Publications
La dysrégulation de la signalisation mTOR est à l'origine de défauts communs de neurites et de migration dans les cellules précurseurs neurales de l'autisme idiopathique et de l'autisme dû à la délétion de 16p11.2.
  • L'objectif de cette recherche était de déterminer s'il existe des similitudes au niveau du développement du cerveau entre les personnes atteintes d'autisme ayant une cause génétique et les personnes atteintes d'autisme n'ayant pas de cause génétique identifiée.Show More
  • Les participants atteints d'autisme sans cause génétique connue ont été invités à participer à l'étude. L'étude a également inclus des participants de Simons Searchlight présentant une délétion 16p11.2. Des échantillons biologiques ont été prélevés sur tous les participants. Des échantillons ont également été prélevés sur les frères et sœurs des participants qui n'étaient pas atteints d'autisme. Les cellules des participants ont été transformées en cellules cérébrales qui ont pu être étudiées en laboratoire.
  • Les chercheurs ont constaté que les cellules cérébrales de laboratoire des participants présentant une délétion du gène 16p11.2 se développaient et se déplaçaient différemment des cellules cérébrales de laboratoire de leurs frères et sœurs, qui ne présentaient pas la délétion. Les cellules présentant une délétion du gène 16p11.2 étaient plus proches des cellules des participants atteints d'autisme sans cause génétique. Ces résultats suggèrent que l'autisme pourrait se développer selon un processus de développement commun.
  • Cependant, les chercheurs ont constaté certaines différences entre les cellules présentant une délétion du gène 16p11.2 et les cellules des participants atteints d'autisme sans cause génétique. Ils ont pensé que les différences pouvaient être dues à la capacité des cellules à répondre aux facteurs de communication.
  • Les chercheurs ont découvert qu'un contrôle étroit du processus de communication cellulaire - ni trop, ni trop peu - est très important pour le développement du cerveau.Show Less
bioRxiv Préprint, (2022)
Prem et al.

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16p11.2 délétion
2022
L'apprentissage automatique contrastif révèle la structure des variations neuroanatomiques dans l'autisme
  • Ces chercheurs ont utilisé l'imagerie cérébrale et des logiciels informatiques pour identifier les structures cérébrales des personnes autistes. Ils ont utilisé l'ensemble de données d'imagerie par résonance magnétique (IRM) Autism Brain Imaging Data Exchange I (ABIDE I) de 470 personnes atteintes d'autisme pour créer les principales théories d'imagerie. Ils ont comparé l'imagerie de personnes autistes à 512 images de personnes non autistes.Show More
  • Les chercheurs ont ensuite utilisé 121 images provenant des données de Simons Searchlight 16p11.2 pour valider ce qu'ils ont trouvé et voir s'ils pouvaient identifier les personnes ayant un diagnostic d'autisme.
  • Les chercheurs ont remarqué des variations dans les structures cérébrales des individus et que certaines parties du cerveau sont plus difficiles à imager que d'autres. Ils ont constaté que les structures cérébrales spécifiques à l'autisme sont différentes selon l'âge, de sorte que les comparaisons doivent être faites au sein des groupes d'âge, et non entre les âges. Ils ont également noté qu'en raison des grandes différences entre les cerveaux, il est difficile de savoir quelles différences sont dues à des variations normales du cerveau et quelles différences sont dues à l'autisme. Il convient donc d'étudier les mêmes cerveaux au fil du temps pour savoir comment ils se développent.
  • Leur modèle informatique a permis d'identifier les structures cérébrales spécifiques à l'autisme et de les relier aux caractéristiques cliniques du participant, telles que les comportements répétitifs et le comportement adaptatif. Les chercheurs ont utilisé les données de Simons Searchlight pour confirmer les résultats de leurs données ABIDE I.
  • Cette recherche a bénéficié d'une subvention de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
La science 376, 1070-1074 (2022)
Aglinskas et al.

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16p11.2 délétion
16p11.2 duplication
2022
Les CPN autistiques de patients idiopathiques et de patients présentant une délétion du gène 16p11.2 présentent une dysrégulation de la prolifération et des réponses mitogéniques.
  • La majorité des personnes diagnostiquées autistes ont une cause génétique connue pour leur autisme, également appelé autisme idiopathique. Seule une personne sur cinq reçoit un diagnostic génétique associé à son autisme.Show More
  • L'objectif de cette recherche était de comprendre pourquoi certaines personnes atteintes d'autisme idiopathique développent une taille de tête supérieure à la moyenne et d'autres non. Pour ce faire, les chercheurs ont utilisé des cellules souches pluripotentes induites (iPSC) fabriquées à partir de participants présentant une délétion 16p11.2, car les personnes présentant cette délétion ont tendance à avoir une taille de tête supérieure à la moyenne. Les iPSC sont un type particulier de cellules qui peuvent être transformées en d'autres cellules du corps, ce qui facilite l'étude de parties du corps difficiles à étudier, telles que les cellules du cerveau.
  • Deux des iPSC, provenant de participants à Simons Searchlight présentant une délétion du gène 16p11.2, ont été transformés en cellules cérébrales en laboratoire. Les chercheurs ont également étudié des iPSC provenant de trois familles participant à l'étude New Jersey Language and Autism Genetics Study et de deux personnes non autistes provenant des National Institutes of Health (NIH).
  • Ce document résume les informations cliniques et intellectuelles sur les participants.
  • Chez tous les participants atteints d'autisme idiopathique, des problèmes de contrôle de la croissance cellulaire ont été constatés. Deux participants ont connu une diminution du nombre de cellules capables de se développer, et un participant a connu une prolifération cellulaire. Tous les participants présentant une délétion du gène 16p11.2 présentaient une croissance cellulaire accrue.
  • Les chercheurs ont testé toutes les cellules pour voir s'il existait des voies génétiques similaires à l'origine des problèmes de croissance cellulaire. Ils ont constaté que les cellules des participants atteints d'autisme idiopathique présentaient des schémas différents de marqueurs génétiques. Les cellules des participants présentant une délétion du gène 16p11.2 présentaient des caractéristiques génétiques similaires.
  • Les chercheurs ont suggéré que l'excès ou l'insuffisance de mécanismes neurodéveloppementaux contribue au développement de l'autisme.Show Less
Cellules souches Rep 17, 1380-1394 (2022)
Connacher et al.

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16p11.2 délétion
2022
Identification de gènes pilotes spécifiques à un type de cellule dans les loci de nombre de copies associés à l'autisme à partir d'organoïdes cérébraux
  • L'objectif de cette recherche était d'étudier quels gènes sont activés et désactivés dans les différents types de cellules du cerveau chez les personnes présentant une variante du nombre de copies (CNV). Un CNV se produit lorsqu'il y a un changement dans une section de l'ADN qui entraîne la suppression ou la duplication d'un gène ou de plusieurs gènes. La délétion 16p11.2 est un exemple de CNV.Show More
  • Les chercheurs ont utilisé des cellules souches pluripotentes induites (iPSC) de a) neuf participants à la recherche de Simons ayant subi une délétion du gène 16p11.2, b) quatre participants avec une duplication 15q11-13, et c) douze participants n'ayant subi aucune modification génétique et provenant d'une autre biobanque. Les iPSC ont été utilisés pour créer des mini-cerveaux en laboratoire. Les chercheurs sont capables de fabriquer des mini-cerveaux qui communiquent entre eux, comme le fait un cerveau humain, mais les mini-cerveaux sont moins complexes que les cerveaux humains.
  • L'étude des CNV est difficile car les personnes qui en sont porteuses ont plusieurs gènes supprimés ou dupliqués. Il est donc difficile de savoir quels gènes peuvent affecter les différentes parties du développement humain.
  • Les chercheurs ont mis au point un nouveau procédé pour séquencer et analyser les cellules individuelles des mini-cerveaux. Ils ont utilisé une technique appelée CRISPR/Cas9 pour modifier les cerveaux et confirmer leurs découvertes génétiques.
  • Les chercheurs ont trouvé trois gènes dans la région 16p11.2 qui pourraient affecter le développement des cellules cérébrales. Il s'agit des gènes YPEL3, KCTD13 et INO80E.
  • Cette recherche a bénéficié d'une subvention de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Nat Commun 13, 3243 (2022)
Lim et al.

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16p11.2 délétion
16p11.2 duplication
2022
Les préférences diagnostiques incluent une discussion sur l'étiologie pour les adultes atteints de paralysie cérébrale et leurs soignants.
  • Les enfants et les adultes qui reçoivent un diagnostic de paralysie cérébrale sont diagnostiqués avec un problème moteur. L'infirmité motrice cérébrale est un trouble du mouvement non progressif et le diagnostic ne permet pas de connaître l'origine du problème. De nombreuses maladies génétiques peuvent être à l'origine de problèmes d'infirmité motrice cérébrale.Show More
  • Les chercheurs ont expliqué qu'il existe une certaine controverse parmi les médecins quant à l'établissement d'un diagnostic de paralysie cérébrale lorsque l'affection est associée à une origine génétique. Ce n'est pas le cas de l'autisme ou de l'épilepsie, qui font également l'objet d'un diagnostic médical et peuvent être d'origine génétique.
  • Les chercheurs ont interrogé des personnes ayant reçu un diagnostic d'infirmité motrice cérébrale et leurs soignants afin de comprendre leurs sentiments à l'égard de cette maladie neurodéveloppementale.
  • Les chercheurs ont envoyé leur enquête à des personnes faisant partie du réseau de recherche sur la paralysie cérébrale et de Simons Searchlight. Cela inclut 16 groupes dans Simons Searchlight: délétion 16p11.2, délétion 1q21.1, ADNP, ASXL3, CHAMP1, CSNK2A1, CTNNB1, DYRK1A, GRIN2B, HIVEP2, PPP2R1A, PPP2R5D, PCHD1, SCN2A, STXBP1, et SYNGAP1.
  • Il y a eu 197 participants, et l'enquête a été envoyée entre décembre 2019 et mai 2020.
  • Il est important de noter que la plupart des participants n'avaient pas de diagnostic génétique associé à leur paralysie cérébrale et que la cause la plus fréquente de la paralysie cérébrale dans ce groupe était une lésion cérébrale. Seule la moitié des personnes interrogées dans le cadre de cette étude ont été informées de l'origine de leur infirmité motrice cérébrale.
  • Trois participants sur quatre ont déclaré qu'ils appréciaient de connaître la cause de leur paralysie cérébrale. De nombreux participants ont apprécié le fait d'avoir un diagnostic de paralysie cérébrale plutôt qu'un diagnostic génétique, car cela leur a permis d'anticiper l'évolution de leurs symptômes, de les expliquer aux autres, d'avoir accès aux services et de comprendre la cause de leurs symptômes.
  • Les chercheurs ont constaté que les personnes atteintes d'infirmité motrice cérébrale et leurs soignants préféraient dans l'ensemble recevoir un diagnostic génétique et un diagnostic d'infirmité motrice cérébrale.
  • Cette recherche a bénéficié d'une subvention de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Dev Med Child Neurol 64, 723-733 (2022)
Aravamuthan et al.

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16p11.2 délétion
ADNP
ASXL3
CHAMP1
CSNK2A1
CTNNB1
délétion 1q21.1
DYRK1A
GRIN2B
HIVEP2
PCHD1
PPP2R1A
PPP2R5D
SCN2A
STXBP1
SYNGAP1
2022
Phénotypes neurodéveloppementaux associés à des variantes pathogènes de SLC6A1
  • Il s'agit de la première publication sur le SLC6A1 qui inclut les données de Simons Searchlight.Show More
  • SLC6A1 signifie solute carrier 6 family member 1 (membre de la famille des transporteurs de solutés 6), et il est important pour les cellules cérébrales de recevoir des signaux d'autres cellules cérébrales. Les modifications du gène SLC6A1 entraînent généralement des crises d'épilepsie. Les crises les plus fréquentes sont les crises d'absence.
  • Les chercheurs ont étudié 28 participants à Simons Searchlight présentant une variante génétique pathogène ou probablement pathogène du gène SLC6A1. Cela s'ajoute aux 116 personnes présentant des variantes génétiques du gène SLC6A1 qui ont été publiées à ce jour dans la littérature médicale.
  • Dans cette étude, la plupart des variantes génétiques étaient de novo, c'est-à-dire qu'il s'agit d'un changement aléatoire qui se produit chez l'enfant. Cependant, certaines variantes génétiques ont été héritées d'un parent.
  • La plupart des participants présentaient des crises d'épilepsie, un faible tonus musculaire, des problèmes de langage ou des retards d'élocution, une déficience intellectuelle ou un retard de développement, et des problèmes de motricité globale.
  • Parmi les caractéristiques médicales moins courantes chez les participants, citons l'autisme, les troubles du mouvement, les problèmes de sommeil et une grande tolérance à la douleur.
  • Cette recherche a bénéficié d'une subvention de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
J Med Genet 59, 536-543 (2022)
Kahen et al.

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SLC6A1
2022
Profil neurodéveloppemental du trouble lié à HIVEP2
  • Il s'agit de la première publication sur HIVEP2 qui inclut les données de Simons Searchlight.Show More
  • Cette étude a porté sur 12 enfants âgés de 3 à 13 ans présentant une variante génétique pathogène ou probablement pathogène du gène HIVEP2. Cette étude vient compléter les connaissances sur HIVEP2, puisque seules 14 personnes ont été décrites dans le cadre de la recherche médicale.
  • Les chercheurs ont constaté que 3 enfants sur 12 souffraient de crises d'épilepsie, que la moitié des enfants étaient autistes et que tous présentaient une déficience intellectuelle. De nombreux enfants présentaient des troubles du langage et un reflux gastro-œsophagien, et la plupart d'entre eux avaient un faible tonus musculaire. Les détails de toutes les caractéristiques médicales observées dans ce groupe d'enfants sont présentés dans un tableau dans le document.
  • Les chercheurs ont suggéré qu'une augmentation des symptômes de l'autisme était associée à un fonctionnement adaptatif plus faible chez les personnes présentant une variante génétique du gène HIVEP2. Le fonctionnement adaptatif fait référence à la manière dont une personne répond aux exigences courantes de la vie quotidienne. Les chercheurs ont également suggéré que l'autisme était sous-diagnostiqué chez les personnes présentant une variante génétique HIVEP2.
  • Cette recherche a bénéficié d'une subvention de la Simons Foundation Autism Research Initiative (SFARI).Show Less
Dev Med Child Neurol 64, 654-661 (2022)
Mo et al.

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HIVEP2
2022